2010年 ESI论文数排名将 医学大学列为世界排名第839名、亚洲排名第216名，位列全台第14名。

2010年 ESI论文被引用次数排名将 医学大学列为世界排名第1096名、亚洲排名第223名，位列全台第11名。2011年QS亚洲大学排名 QS ASIAN UNIVERSITY RANKINGS将 医学大学列为亚洲排名第89名，位列全台第9名，与长庚大学同为私立大学首位。2011年QS世界大学排名 QS WORLD UNIVERSITY RANKINGS英国世界大学排名机构QS於9月5日公布2011/2012年， 医学大学首度荣登世界前四百名大学，世界排名第373名，位列全台第6名、私校第1名。在生命科学暨医学教师领域排名（Rankings by Faculty in Life Sciences and Medicine）， 医学大学世界排名第105名。2011年西班牙世界大学网路排名 RANKING WEB OF WORLD UNIVERSITIES将 医学大学列为世界排名第999名，位列全台第21名，医学大学首位。2011年上海交通大学两岸四地大学排名将 医学大学列为两岸四地排名第49名，位列全台第13名，医学大学首位。104人力银行与《远见杂志》共同主办的「2012企业最爱研究所评鉴调查」在「医疗/卫生/护理」部分位居私校第一，仅次於国立 大学与国立阳明大学，与国立成功大学并列全国第二。2011年私立高教体系产学合作绩效评量在「争取产学经费与效率」上， 医学大学排名第1名。在「产学合作成效广泛程度」上， 医学大学排名第7名。在「智权产出成果与应用效率」上， 医学大学排名第2名。2012年QS亚洲大学排名 QS ASIAN UNIVERSITY RANKINGS将 医学大学列为亚洲排名第64名，位列全台第9名，为私立大学首位。