1952年全国院系调整时东吴大学与苏南文化教育学院、江南大学数理系合并为苏南师范学院，同年定名为江苏师范学院，在原东吴大学校址办学。

1982年经国务院批准改办为苏州大学。经教育部和江苏省省政府批准，苏州蚕桑专科学校、苏州丝绸工学院、苏州医学院先后于1995年、1997年、2000年并入苏州大学。设立于上海昆山路146号的东吴大学法学院，法律系并入华东政法学院（今华东政法大学），会计系和原东吴大学法学院院址并入上海财政经济学院（今上海财经大学）。