专业设置圣安德鲁斯大学设有 3 个学院：文学院、神学院和理工学院(包括医学)。 3 个学院分成 14 个系院，又进一步分成一些独立的专业，共开设 100 多个本科单科专业学位课程和 300 多个本科双科专业学位课程。多数的专业都开设文学硕士(文学院与神学院)、哲学硕士和博士的研究生课程。此外，St. Andrews University内还设有 16 个研究所。所设专业有：社会人类学天文学，生物学，化学，计算机，地理学，地球科学，体育，物理学，心理学，统计学。杰出课程：经济学，化学，地理学，数学和统计学，物理学，历史学，细胞和分子生物学，有机生物学，欧洲语言，心理学研究水平优秀系科：英语语言文学(5*)； 心理学(5*)；人类学；应用数学；生物科学；化学； 古典文学，古代历史，拜占庭及现代希腊研究；计算机科学； 历史艺术史，建筑和设计；哲学； 物理，纯数学； 伊比利亚和拉丁美洲语言； 政治与国际研究； 统计与运筹学； 神学，神学和宗教研究英语作为第二语言，前期英语课程，学期英语课程，科学英语。

圣安德鲁斯大学同其他的苏格兰大学相同，本科为四年制，然而不同的是其只由四个学院组成，分别为文学院，理学院，神学院和医学院，以及一些跨学院学科（Cross Faculty Subjects）组成。并不开设非常常见的法学院和商学院。文学院 Faculty of arts现代语言 School of Modern Languages联合学院历史 School of History国际关系 School of International Relations英语 School of English英语语言教学 English Language Teaching艺术史 School of Art History经典文学 School of Classics古代历史经典研究希腊语拉丁语哲学，人类学与电影研究 School of Philosophical, Anthropological and Film Studies电影研究哲学音乐学院社会人类学音乐现代语言 School of Modern Languages阿拉伯语 Department of Arabic法语 Department of French德语 Department of German意大利语 Department of Italian俄语 Department of Russian西班牙语 Department of Spanish比较文学理学院 Faculty of Science生物 School of Biology圣玛丽学院化学 School of Chemistry计算机科学 School of Computer Science物理与天文学 School of Physics & Astronomy地理与地球科学 School of Geography & Geosciences地球与环境科学 Department of Earth & Environmental Sciences神学院 Faculty of Divinity神学 School of Divinity圣经学新经研究管理学院神学研究医学院 Faculty of Medicine医学 School of Medicine跨学院学科 Cross Faculty Subjects经济学与金融 School of Economics & Finance地理与地球科学 School of Geography & Geosciences地理与可持续发展研究 Department of Geography & Sustainable Development管理学 School of Management数学与统计 The School of Mathematics and Statistics