经陕西省人民政府批准在西京大学的基础上成立了西京职业学院，并成立党委，任万钧任学院党委书记、院长。

在他的领导下，学院三年迈了三大步，招生连年爆满，跨入了万人大学行列。2001年，根据学校发展需要，在长安区征地千亩，全校教职工在任万钧的带领下团结一致、挑战极限，仅用160天的时间完成16万平方米的校园基本建设任务，并当年招收新生近万人，实现了当年征地、当年建设、当年投入使用，创造了我国高等教育规模发展式上的奇迹。民办高校是新事物，没有现成经验可以借鉴。在学校规模发展和质量建设的几年里，任万钧同志率先垂范，无私无畏，拖着多病的身体，日夜奋斗在学校建设和管理一线，全身心的投入到学校的建设和教育教学管理中。用他自己的话说：1%的时间在家，1%的时间在校外开会、考察，98%的时间完全吃住在校。虽说有些夸张，但也不言过其实。通过他及全体教师职工的艰辛努力，现西京职业学院拥有东、南两校区共占地1600多亩，建筑面积近50万平方米，是全国著名万人民办高校，为国家积累7亿元固定资产，并通过多种途径，盘活了陕西高等教育资源，为我省经济社会的发展做出了一定贡献。