从两个层次上区分，一个是国家承认的区分上，一个是招生的第一批、第二批、第三批等分类。
首先，纠正你的观点，普通高校包括重点大学以及二本、分校、三本、独立院校，之所以统称为普通高校，是相对于自考、函授、成人大学而言，你可以在moe官方网查到普通高校名单中有清华大学。
①一本： 985工程大学、211工程大学以及国家承认的重点大学。 注：能同时是985和211工程的大学，基本全国排名不会低于35名。 且在高考报名上，都肯定有全国大部分第一批名额。 一本也分省一本和全国一本，省一本是省教育厅认可的重点大学，全国一本是国家教育部认可的重点大学。
②二本： 有些二本院校能在第一批招生，但由于不被省、国家认为是重点高校，所以仍然是二本。凡是能够常年在第二批本科录取上百人以上的高校，都认为是二本。 在这里，少部分民办高校和名校分校、独立院校属于二本（北师珠海分校、南昌理工学院、蓝天学院等，属于二本）。而是几本和名字没有必然关系，比如，北京吉利大学是专科院校。
③三本： 大部分独立院校和民办高校、分校属于三本（国外分校无此种分类），因为常年在第三批录取。 ④用集合表示的话更清楚：重点高校={211工程，985工程，国家承认，省内承认}；二本高校={常年最高在第二批次本科录取以及部分在第一批录取但未被国家、省认定为重点大学的高校，以及极少部分民办高校和独立、分校}；三本高校={常年在第三批次本科录取，独立院校、民办高校、分校占大部分}；以上三类高校颁发的学历证书和学士证书具有同等效力，都能颁发统招本科毕业证书和统招本科学士证书。职业高校={最高只能颁发统招大专毕业证，不颁发学位证}技师院校={颁发各类层次技师证}
