日本大学联盟RU11里面的东京大学和京都大学。

可见：

民间排名把日本的大学共分为了S级到F级。其中，S级大学最好，是国际超一流大学；A级其次，是国际一流大学；再往下是B类国内一流大学、C类国内准一流大学、D类国内二流大学，以此类推超过600所大学被归为E、F级别大学。国际超一流大学SⅠ级:东京大学SⅡ级:京都大学、东北大学国际一流大学AⅠ级:大阪大学、东京工业大学AⅡ级:名古屋大学、九州大学AⅢ级:北海道大学、庆应义塾大学、一桥大学AⅣ级:筑波大学、东京外国语大学、早稻田大学没在名单之内的就别考虑了，还不如国内的了

1、早稻田大学、横滨国立大学、名古屋大学、小樽商科大学等等都是很好的；

2、建议你不要把眼光仅仅局限在国公立上，如果经济条件许可，日本很多私立大学都是不错的选择，而且相对竞争要小得多。