两者的区别可概括为3+3+25，这次双一流建设高校名单就是在原985211高校基础上的小调整，小增补。双一流分为一流大学建设高校AB类，一流学科建设高校，其中一流大学建设高校A类36所是由原985高校(除湖南大学，东北大学，西北农林科技大学外)组成，B类6所则是由上述没入选A类的3所原985和3所原211郑州大学，云南大学，新疆大学组成，而一流学科建设高校95所是由原211(除郑云新)高校和新增25所高校组成。这25所学校分别为北京协和医学院，中国科学院大学，中国人民公安大学，首都师范大学，外交学院，中国音乐学院，中央美术学院，中央戏剧学院，天津工业大学，天津中医药大学，西南石油大学，成都理工大学，成都中医药大学，广州中医药大学，河南大学，南京林业大学，南京信息工程大学，南京邮电大学，南京中医药大学，宁波大学，中国美术学院，上海中医药大学，上海海洋大学，上海体育学院，上海音乐学院。

双一流比985/211工程的覆盖面要广。双一流包含两个层次，世界一流大学和世界一流学科。第一个层次，世界一流大学，包括以前所有的39所985院校，以及3所原211院校（郑州大学、云南大学、新疆大学），可以称之为985的放大版。第二个层次，世界一流学科，包含以前的所有211院校，以及部分非211的院校，可以称之为211的放大版。