药学专业最好的985院校是北京大学和清华大学协和医学院。
判断一个学校的一个学科是不是好,就看这个学校的这个学科有没有重点学科、有哪一个级别的重点学科。如果一个学校有国家重点一级学科,那么就可以说这个学校的这个学科是国内顶尖水平的。如果一个学校虽然没有这个学科的国家重点一级学科,但是有国家重点二级学科,那么可以说这个学校在这个学科领域是国内领先的,跟顶尖水平还有一点点差距。一共有四个药学的国家重点一级学科,分别是北京大学、清华大学协和医学院、中国药科大学、第二军医大学。这里面,中国药科大学和第二军医大学是211不是985,所以药学专业最好的985大学就是北京大学和清华大学协和医学院。