1.使用民办大学的本科毕业证书可以读在职研究生，但不能报考全日制研究生，因为全日制研究生报考条件明确规定只允许全日制国民教育系列才能报考。

2.民办大学的学历是国家承认的非国民教育系列，属于民办高校颁发的毕业证书，民办高校的毕业证书照比公办院校的全日制国民教育系列毕业证书有一定差距，主要体现在报考研究生和公务员考试会受到一定的限制，但在求职、就业，单位的定岗、晋级、职称评定、各类资格考试等方面均可以通用，属于同等学历。(可参考中华人民共和国民办教育促进法第三十三条）3.国家规定专科毕业工作满三年，本科毕业工作满一年即可以报考在职研究生，在职研究生同全日制研究生均可以申请由国家学位办公室发放的硕士学位，但在职研究生只能拿到研究生结业证书，而全日制研究生可以拿到研究生的毕业证书，也就是说其学历证书有区别，学位证书是相同的。