东京大学并没有正式意义上的所谓“校徽”，右边黄青相间的图案只是东京大学长久以来的“标识”，它来源于昭和23年6月的校理事会上星野昌一教授绘制的图案。

图案由一黄一青两枚互相交叠的银杏叶组成，银杏是东京大学校园内栽植最为广泛的树种，沿街而立，每逢秋季黄叶遍地、覆满整个校园，因此金黄的银杏叶寓意东大最美丽的一面；而另一片银杏叶的颜色则源于东大传统的代表色——淡青。与校徽相同，即便东京大学是一所有着超过百年办学历史的老校，直到今天，东大也没能选出一首公认的“校歌”；2004年6月，东京大学曾专门成立校歌制定委员会开展校歌征选活动，最终选出「ただ一つ」与「大空と」两首歌曲，依据不同场合，代行“校歌”之职。 「ただ一つ」 「大空と」 （东京大学运动会歌）作词大森幸男作曲山口琢磨作词北原白秋作曲山田耕筰一、ただ一つ旗かげ高しいまかがやける深空の光天宠を负える子ら友よ友ここなる丘に东大の旗立てり伝统の旗东大の光たたえたたえんたたえたたえん二、ただ一つ歌ごえ高しいまなりわたる疾风の力双眼の澄める子ら友よ友ここなる杜に东大の歌涌けり伝统の歌东大の力たたえたたえんたたえたたえん一、大空と澄みわたる淡青厳たり我が旗高く开かん仰げよ梢を银杏のこの道蕴奥の穷理応じて更に人格の陶冶ここに薫る栄光の学府巍々たり赤门我が赤门高く开かん二、大空と新しき淡青冴えたり我が旗风と光らん楽しめ季节を思虑あれこの道文明の证自由と常に甚深の调和ここに明る精神の学府満ちたり赤门我が赤门风と光らん三、大空と揺り动く淡青生きたり我が旗云と兴らん羽ばたけ搏力どよめよこの道青春の笑い爆けてすでに健腕の矜ここに跃る堂々の学府こうたり赤门我が赤门云と兴らん 校色东京大学的代表色是“淡青色”，其源于一场竞技。东京大学与京都大学之于日本，酷似牛津大学与剑桥大学之于英国，东大与京大长期保持着相争共进的友好关系；在很久很久之前（传为1920年）两校之间进行的一场划艇比赛中，由东京大学与京都大学抽签决定各自所乘赛艇，两校抽到的赛艇艇身分别为淡青色和浓青色，自那以后，这两种颜色也就成了他们双方的代表色，最后逐步演变为校色。而在东京大学内部，各个学部也分别拥有自己的代表色。院色法学部 绿色医学部 红色工学部 白色理学部 桦色农学部 紫色经济学部 青色教养学部文科 黑色教养学部理科 黄色教育学部 橙色药学部 胭脂色