基金委设委员会和秘书处。

委员会为咨询、审议机构，秘书处为常设工 作机构。基金委秘书处的主要职责是，贯彻执行委员会制定的工作方针和计 划；组织实施有关出国留学和来华留学的资助工作，制定有关管理规定和办 法，负责办理资助项目的申请、评审、审批以及经费发放等方面的事务，并 提供相关的咨询和服务；监督和检查接受基金委资助的项目和人员使用基金 的情况等。注：目前，亚非及南太地区事务部与欧洲事务部和美洲事务部合署办公。亚非事务划归欧洲事务部；南太地区划归美洲事务部。