1. 本科——生物医学工程理学学士本科阶段，波士顿大学生物医学工程系开授理学学士学位。

这个专业将工程实践、研究与生命科学研究融合，在世界级的城市科研机构中培训学生。这个本科专业融全面的工程培训、内容丰富的生命科学课程、研究理论和系统生理学于一体，为学生提供创新研究和行业工作必须的现实工具。友善、互助的氛围允许学生在学业期间以学人或个人的角色成长，有助于学生在将来的就业。

2. 研究生——生物医学工程工程学硕士、理学硕士、博士、医学博士/生物医学工程博士研究生阶段，波士顿大学的生物医学工程系提供完备的系列学位，包含工程学硕士、理学学士、博士及联合博士。生物医学工程工程学硕士这是一个专业硕士学位，主攻医疗器械，适合想从事医疗器械和技术行业的学生。课程可以量身定制，共含32个学分，为学生提供严谨的生物医学工程研究生教育。专业水准的项目经历有助于学生在将来从事医疗器械行业。这个专业的学生通过高级专业课深入掌握专业技能，接触产品开发、知识产权、商业化等话题。此外，学生需要完成一门实习课，在其中进行高级课程设计，同临床人员一起为医疗问题寻找和制定创新专业解决方案。专业优势生物医学工程工程学硕士为学生提供生涯策略规划和实施所需的专业教育和知识技能，协助学生就业。职业发展是这个专业的一个重要的辅助特征。教师、校友和同学分享联络资源、指导，提供建议和援助，协助每一位学生实现职业目标。生物医学工程理学硕士这个学位旨在提供本领域高级培训。所有学生必须完成一份实践。实践形式可以是完成一个获批项目，也可以找到一个研究方向，从事原创研究并写作一篇论文。纳米医学方向纳米医学是一个新兴的跨学科领域，它对研究员有很大的需求。这个领域的研究员具有独特的知识和技能，能将纳米科学与纳米技术运用于解决医学问题。纳米医学方向让理学硕士生有机会扩展基础知识，培养高级能力。选择这个方向的理学硕士生需要完成标准的生物医学工程理学硕士学位要求，但是coursework 将主要涉及纳米医学，项目也必须直接与纳米医学面临的挑战有关。通过coursework和指导研究，这个方向的学生将学习如何将多个学科的知识、理念和技能整合，将纳米技术运用于应对医学面临的挑战。毕业生有能力将纳米技术运用于工业、咨询岗位，也可以进一步攻读医学博士、生物医学工程博士或者联合博士。生物医学工程博士这个博士学位直接接收持有理学学士学位的学生。它要求学生必须完成指定课程和研究，修满毕业所需的64个学分。课程要求分子生物工程、工程师定量生理学、生物医学工程研讨、实验轮转、文献综述、数学、教学实践、三门研究生选修、两门研究生技术选修、研究(不低于12个学分)。除了学分要求之外，每一位学生必须顺利通过口语资格考试、写作并完成论文答辩。医学博士/生物医学工程博士医学博士/生物医学工程博士联合项目由医学院和研究生医学科学系提供。该项目专门提供给强烈渴望从事医学教育和研究的学生，向这类高素质的学生开放。该项目的目的是让学生有机会接受医学科学相关教育和研究培训，接触和深入了解临床医学。医学博士/生物医学工程博士联合项目预计(但不要求)学生将选择从事基础医学科学(前临床)一个方面的研究并接受博士培训。不过，该项目也给与学生极大的选择的自由。该项目至少需要七年时间完成，平均需要把八年半时间完成。具体时间取决于医学院基础科学课程在博士研究课程要求的适用度。