安徽理工大学医学院始建于1985年，原为国家煤炭工业部直属的高等院校--华东煤炭医学专科学校。

后合并入安徽理工大学，成立安徽理工大学医学院。二十多年来共为国家培养学生近万名。设置有临床医学专业、医学检验技术专业、护理学专业、预防医学专业、药学专业5个本科专业，设有病原生物学、医学免疫学、生物医学工程3个硕士点，设有传染性疾病研究所、消化病研究所、生殖医学研究所、生物医学工程4个研究所。实验室设施完善，仪器、设备先进且配套齐全，有综合实验室14个，符合GMP标准的分子生物学实验室1个，总面积达1万余平方米，承担基础医学、临床医学、预防医学专业、医学检验技术、护理学专业100余门课程理论、实验教学。在校本科生2000余名，研究生50余名。医学院现有附属医院3所{安徽理工大学第一附属医院和安徽理工大学第一临床医学院——淮南市第一人民医院（三甲）、安徽理工大学附属医院-淮南东方医院集团（三乙)、上海奉贤区中心医院（二甲）：安徽理工大学（非直属）附属医院和安徽理工大学临床医学院}和教学医院13所，其中三级甲等医院1所，三级乙等医院4所，二级甲等医院7所，分布在安徽、山东、江苏、上海、贵州等地，附属、教学医院共有病床数7500余张，正高职称教学人员179人，副高职称464人，承担着学生见习、实习的教学工作。学院注重对学生进行德、智、体全面培养，提高学生的综合素质。坚持以教学为中心，加强管理，深化改革，严谨治学，确保质量。教学过程中，在加强理论知识教育的同时，特别注意对学生实际操作能力的培养，实验课实行项目-导师制，培养学生的科研创新及实践能力，使学生具有较扎实的理论基础，能独立进行多项基本技术操作，适应临床工作需要。培养出的学生深受用人单位的欢迎。医学院结合自身的特点和地区优势，在搞好教学工作的同时，积极开展科研工作。主要科研方向为生物毒理学、医学蜱螨与人类疾病、免疫学与变态反应性疾病、脐血干细胞、病原生物感染与消化道疾病、病毒性肝炎、创伤休克机理、遗传病与染色体疾病研究、生殖功能与不孕不育、煤矿创伤急救、蛋白质工程与生物芯片等。学院承担省、部科研课题及横向科研课题60余项，其中通过省部级科研成果鉴定项目10余项，市级科研成果鉴定项目10余项；鉴定结论达到国际先进、国内领先水平的研究成果有12项，国内先进水平的研究成果有9项。研究成果获省部级自然科学三等奖3项，科技进步二等奖3项、三等奖8项，获地市级科技成果一等奖3项，二等奖6项。学院教学科研人员在各级各类正式期刊杂志发表研究论文678篇，其中近10篇论文被 SCI收录，150余篇发表在国家权威或核心期刊；每年均有多篇论文在国家或省级优秀论文评选中获奖。学院教学科研人员作为主编（著）或副主编（著）出版专著18部，教科书11部。