卫斯理女校开设的专业主要有非洲研究、人类学、天文学、生物科学、生物化学、化学、中文、计算机科学、经济学、英语、法语、地球科学、德语、希腊语、历史学、艺术史、意大利语、日语、拉丁语、数学、音乐、哲学、物理学、政治学、心理学、宗教学、俄语、社会学、西班牙语、室内设计、女性研究、美国文化学、建筑学、天体物理学、生物化学、电影与媒体研究、古代文明、近代考古学、认知与语言科学、东亚研究、环境研究。

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