一、专业不同

1、工程管理

工程管理专业培养具备管理学、经济学和土木工程技术的基本知识，高级管理人才。学生在校学习期间，要接受工程师和经济师的基本素质训练，打好工程技术、管理、经济、法律、外语及计算机应用方面的坚实基础。

2、管理科学与工程

管理科学与工程是综合运用系统科学、管理科学、数学、经济和行为科学及工程方法，结合信息技术研究解决社会、经济、工程等方面的管理问题的一门学科。

这一学科是我国管理学门类中唯一按一级学科招生的学科，覆盖面广，包含了资源优化管理、公共工程组织与管理、不确定性决策研究和项目管理等众多研究领域，是国内外研究的热点。

二、就业方向不同

1、工程管理

本专业毕业生主要就业于涉外工程建设领域，诸如国际工程承发包市场、建筑业、房地产业、监理公司、工程咨询业、工程设计业及其主管部门等，可以出国，可以在政府部门工作，可以从事国际工程项目整体规划、项目决策、项目全过程管理、涉外建筑企业生产与经营、国际工程咨询与监理、工程技术经济分析和工程管理科学研究等工作。

2、管理科学与工程

主要从业领域为：国家各级行政管理部门、国内外大中型工商企业、外资企业、跨国公司、三资企业等从事决策咨询、商务运作及管理工作；高等院校或科研机构从事相关专业的教学与科研工作。

三、专业能力不同

1、工程管理

1）掌握工程管理的基本理论和方法。

2）掌握投资经济的基本理论和基本知识。

3）熟悉土木工程技术知识。

4）熟悉工程项目建设的方针、政策和法规。

5）了解国内外工程管理的发展动态。

6）具有运用计算机辅助解决管理问题的能力。

2、管理科学与工程

1）掌握管理学科的基本理论、基本知识和方法。

2）具有定量分析和计算机应用的基本能力。

3）具有基本的管理沟通、协同合作和组织实施的工作能力。

4）熟悉有关管理的方针政策和法规。

5）了解管理科学的应用前景。

6）掌握文献检索、资料查询的基本方法，具有初步的科学研究和实际工作能力。

参考资料来源：百度百科-工程管理

参考资料来源：百度百科-管理科学与工程