学院目前设机械工程和电子与计算机工程两个专业，但由于学院采用独特的培养模式，即学生进校时不分专业，统一按理工科大平台培养，一年半后根据个人志愿选择（不受高考志愿影响）和成绩要求进入专业学习，学院在各地的招生只设一个专业代码，考生可以认为是按院招生，不必考虑具体的专业。如果成功被录取到交大-密西根本科双学位的学习中，第二个专业可以到美国密西根大学在更多的领域选择，包括工程类的各种专业如航空工程、船舶建造与海洋工程、材料科学与工程、工业工程与运筹工程、生物医疗工程、化学工程、计算机科学与工程、土木建筑与环境工程、核工程与放射科学、机械工程、大气海洋与太空科学、电机工程等，以及各种非工程类的专业，如数学、物理、化学、金融、社会、教育、心理等。

上海交通大学交大密西根学院专业有2个：机械工程计算机和电子工程只是这2个