生物系统工程与食品科学学院(简称“生工食品学院”)现设有生物系统工程和食品科学与营养等2个系和农业生物环境工程、生物机电工程、食品科学与发酵工程、农产品产后工程、水土工程与城乡建设、生物系统自动化与信息技术等6个研究所，一个院级教学实验中心，另外还设有亚太临床营养学会营养与食品安全中心、浙江省农产品产后技术研究中心及食品科学技术研究中心。