东南大学四牌楼校区的专业主要有：建筑学、城乡规划、风景园林、建筑环境与设备工程、环境工程、土木工程、工程管理、工程、电子科学与技术、自动化、机器人工程、生物医学工程、生物信息学、智能医学工程、电气工程及其自动化、交通工程、交通运输、道路桥梁与渡河工程、城市地下空间工程、测绘工程、金属材料、土木工程材料、电子信息材料、材料加工等。

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