九州大学的学年始于每年4月1日，直到翌年3月31日结束。

前学期为4月～9月，后学期为10月～次年3月。每年有三个假期，分别为：夏假(8月初～9月底)、冬假(12月下旬～1月上旬)、春假(4月初)。此外，九州大学每年10月举行运动会，休假一天；11月下旬举行九大祭，为期5天。本科学制一般为4年，医学、牙医学需要6年；在大学院学习2年，完成博士前期课程，可以取得硕士学位；再学习3年，完成博士后期课程，可以取得博士学位。医学、牙医学研究所(硕士专业除外)在读完本科6年的基础上，再攻读4年，可以直接取得博士学位。