截至2014年12月，学校共有29个学院、直属系，27个直属单位，14家附属医院，在62个本科专业招生 。

院系设置上海交通大学船舶海洋与建筑工程学院 上海交通大学药学院上海交通大学机械与动力工程学院上海交通大学人文学院上海交通大学核科学与工程学院上海交通大学安泰经济与管理学院上海交通大学电子信息与电气工程学院上海交通大学中欧国际工商学院上海交通大学信息安全工程学院上海交通大学凯原法学院上海交通大学软件学院上海交通大学国际与公共事务学院上海交通大学微电子学院上海交通大学媒体与设计学院上海交通大学材料科学与工程学院上海交通大学外国语学院上海交通大学理学院数学系上海交通大学马克思主义学院上海交通大学理学院物理与天文系上海交大-巴黎高科卓越工程师学院 上海交通大学化学化工学院上海交通大学体育系上海交通大学环境科学与工程学院上海交通大学密西根学院上海交通大学生命科学技术学院上海交通大学航空航天学院上海交通大学生物医学工程学院上海交通大学上海高级金融学院上海交通大学农业与生物学院上海交通大学创业学院上海交通大学医学院上海交通大学继续教育学院上海交通大学致远学院上海交通大学国际教育学院上海交通大学海外教育学院普通本科招生专业一览学院名称招生专业名称分流专业名称船舶海洋与建筑工程学院海洋工程类 土木类船舶与海洋工程交通运输土木工程工程力学建筑学（五年制）机械与动力工程学院机械类机械工程能源与动力工程工业工程核工程与核技术新能源科学与工程机械工程（国际化人才培养试点班）机械工程与自动化试点班热能与动力工程试点班电子信息与电气工程学院电子信息类自动化信息工程电子科学与技术计算机科学与技术测控技术与仪器电气工程及其自动化电子信息科学与技术（IEEE本硕连读试点班）信息安全工程学院信息安全软件学院软件工程微电子学院微电子科学与工程材料科学与工程学院材料科学与工程数学系数学与应用数学物理系物理学类物理学应用物理学国际化人才培养试点班化学化工学院化学类化学工程与工艺应用化学环境科学与工程学院环境科学与工程生命科学技术学院生物技术生物技术生物工程生物科学生命科学与技术基地班（六年）生物学理科基地班生物-信息贯通试点班生物医学工程学院生物医学工程生物医学工程生物医学工程本硕贯通试点班农业与生物学院自然保护与环境生态类园林资源环境科学食品科学与工程动物科学植物科学与技术药学院药学人文学院汉语言文学（文）安泰经济与管理学院经济学类（文、理）金融学国际经济与贸易经济学会计学凯原法学院法学（文、理）国际与公共事务学院公共管理类（文、理）行政管理媒体与设计学院传播学（文、理）工业设计广播电视编导（文、理）设计学类（艺）公共事业管理（文）外国语学院英语（文、理）英语（金融、商务）涉外法律事务贯通试点班日语（文、理）德语（文、理）交大密西根学院机械类（交大密西根学院）电子信息类（交大密西根学院）机械工程电子与计算机工程航空航天学院航空航天工程致远学院从优秀新生中选拔,进入“基础学科拔尖学生培养试验计划”数学班物理学班生命科学班化学班计算机科学班（原ACM班）数学系、安泰经济与管理学院理科试验班类（数学-金融贯通试点班）数学-金融本硕贯通试点班电子信息与电气工程学院、安泰经济与管理学院工科试验班类（工科-管理贯通试点班）工科-管理本硕贯通试点班交大-巴黎高科卓越工程师学院机械类（交大-巴黎高科卓越工程师学院）电子信息类（交大-巴黎高科卓越工程师学院）机械工程信息与通信技术能源与动力工程上海交通大学医学院本科招生专业学院名称招生专业名称年制临床医学院临床医学（本博连读） 八年制临床医学（本博连读法语班）八年制临床医学五年制临床医学（儿科学方向）五年制临床医学（英语班）五年制口腔医学院口腔医学（本硕连读）七年制公共卫生学院预防医学五年制营养系食品卫生与营养学四年制检验系医学检验技术四年制护理学院护理学四年制 截止2014年1月，学校有一级学科博士学位授权点36个，一级学科硕士学位授权点57个，博士专业学位授权点3个、硕士专业学位授权点21个；拥有9个一级学科国家重点学科，11个国家二级重点学科，7个国家重点（培育）学科，上海市重点建设的学科数55个；另设有32个博士后流动站。 重点学科国家重点学科类别学科名称一级学科（9个）船舶与海洋工程机械工程生物医学工程力学材料科学与工程动力工程及工程热物理控制科学与工程计算机科学与技术管理科学与工程二级学科（11个）生物化学与分子生物学凝聚态物理光学遗传学电磁场与微波技术通信与信息系统儿科学内科学外科学口腔临床医学病理学与病理生理学内科学 上海市重点学科光学高分子化学与物理 微生物学遗传学生物化学与分子生物学流体力学车辆工程岩土工程 蔬菜学企业管理医学基因组学组织工程学 口腔颌面外科学内分泌与代谢学消化病医学肾脏医学 口腔修复与生物材料学风湿病学儿科学发育生物学医学免疫学硕博点上海交大博士硕士学位授权点授权类别序号学科代码学科名称授权时间所在行政单位一级学科博士点10202应用经济学2011.03安泰经济与管理学院20301法学2011.03凯原法学院30502外国语言文学2011.03外国语学院40701数学2003.09理学院数学系50702物理学2000.12理学院物理系60703化学2011.03化学化工学院70710生物学2003.09生命科学技术学院、农业与生物学院、医学院80713生态学2011.09农业与生物学院90714统计学2011.09理学院数学系100801力学1998.06船舶海洋与建筑工程学院110802机械工程1998.06机械与动力工程学院120803光学工程2003.09理学院物理系130804仪器科学与技术2000.12电子信息与电气工程学院140805材料科学与工程1998.06材料科学与工程学院150807动力工程及工程热物理1998.06机械与动力工程学院160808电气工程2000.12电子信息与电气工程学院170809电子科学与技术2000.12电子信息与电气工程学院180810信息与通信工程2000.12电子信息与电气工程学院190811控制科学与工程1998.06电子信息与电气工程学院200812计算机科学与技术2000.12电子信息与电气工程学院210814土木工程2011.03船舶海洋与建筑工程学院220824船舶与海洋工程1998.06船舶海洋与建筑工程学院230827核科学与技术2011.03机械与动力工程学院240830环境科学与工程2003.09环境科学与工程学院250831生物医学工程1998.06生物医学工程学院、医学院260835软件工程2011.09软件学院270902园艺学2011.03农业与生物学院281001基础医学2000.12医学院291002临床医学2003.09医学院301003口腔医学1998.06医学院311004公共卫生与预防医学2011.03医学院321007药学2011.03药学院、医学院331011护理学2011.09医学院341201管理科学与工程1998.06安泰经济与管理学院351202工商管理2003.09安泰经济与管理学院361204公共管理2011.03国际与公共事务学院二级学科博士点1030503马克思主义中国化研究2006.01马克思主义学院20702Z1★物理学史2004.03科学史与科学文化研究院30710Z1★细胞培养与代谢工程2002.12生命科学技术学院40802Z1★工业工程2002.12机械与动力工程学院5081704应用化学2003.09化学化工学院6100602中西医结合临床*1982.11医学院71202Z1★媒介管理2006.12媒体与设计学院8120301农业经济管理*2003.09安泰经济与管理学院一级学科硕士点10302政治学2006.01国际与公共事务学院20305马克思主义理论2006.01马克思主义学院30401教育学2011.03高等教育研究院40402心理学2011.03精神卫生中心50403体育学2011.03体育系60501中国语言文学2006.01人文学院70503新闻传播学2006.01媒体与设计学院80712科学技术史2000.12科学史与科学文化研究院90813建筑学2011.09船舶海洋与建筑工程学院100817化学工程与技术2006.01化学化工学院、生命科学技术学院110823交通运输工程2011.03船舶海洋与建筑工程学院120825航空宇航科学与技术2011.03航空航天学院130828农业工程*2011.03农业与生物学院140832食品科学与工程2006.01农业与生物学院150834风景园林学2011.09农业与生物学院160904植物保护*2006.01农业与生物学院170905畜牧学2006.01农业与生物学院181008中药学*2006.01药学院191205图书情报与档案管理*2006.01图书馆201303戏剧与影视学2011.09媒体与设计学院211305设计学2011.09媒体与设计学院二级学科硕士点1010101马克思主义哲学1986.07人文学院2010108科学技术哲学1996.06科学史与科学文化研究院3020104西方经济学2003.09安泰经济与管理学院40602L3专门史2006.01人文学院5070401天体物理*1996.06理学院物理系6071101系统理论*1998.06理学院数学系7081505港口、海岸及近海工程2000.12船舶海洋与建筑工程学院8090102作物遗传育种*2000.12农业与生物学院9090602预防兽医学*2000.12农业与生物学院10100501中医基础理论1986.07医学院11100508中医骨伤科学1986.07医学院12110505密码学*2003.09电子信息与电气工程学院注; 截止2012年7月。★指自主设置，*指暂停招生。博一36个，博二8个（含自主设置4个），硕一57个，硕二12个。 博士后流动站 船舶与海洋工程机械工程动力工程与工程热物理核科学与技术电气工程控制科学与工程计算机科学与技术电子科学与技术信息与通信工程仪器科学与技术材料科学与工程数学物理学生物医学工程力学工商管理管理科学与工程外国语言文学生物学环境科学与工程临床医学药学化学园艺学土木工程应用经济学光学工程软件工程法学生态学学科评估2007~2013年，教育部开展第三次一级学科整体水平评估，上海交通大学部分评估结果如下表 。专业名称全国排名专业名称全国排名临床医学1船舶与海洋工程1机械工程1生物医学工程3口腔医学2控制科学与工程4基础医学3材料科学与工程5动力工程及工程热物理3电子科学与技术6科学技术史3通信与信息工程4核科学与技术5管理科学与工程6计算机科学与技术4园艺学6药学10仪器科学与技术10工商管理8电气工程10物理学6力学12法学11土木工程19新闻传播学10外国语言文学10建筑学13环境科学与工程14生物学3化学15公共管理7数学13应用经济学6食品科学与工程16 截至2013年12月，学校有专任教师2851名，其中教授872名；中国科学院院士18名，中国工程院院士22名，中组部顶尖“千人计划”1名，“千人计划”长期项目71名、外专项目6名、短期项目7名，“青年千人”56名，“长江学者”特聘教授和讲座教授共117名，国家杰出青年基金获得者98名，国家重点基础研究发展计划（973计划）首席科学家30名，国家重大科学研究计划首席科学家14名，国家基金委创新研究群体9个，***教学团队8个，教育部创新团队20个。 上海交大优秀年轻人才中的杰出代表有：“机械制造及自动化”学科“长江学者奖励计划”特聘教授、“美国总统奖”和“美国国家优秀青年制造工程师奖”获得者、美国Michigan大学吴贤铭制造技术中心主任倪军教授。国家HDTV（高清晰度电视）攻关项目总体组组长、首批“长江学者奖励计划”特聘教授、2000年全国五四青年奖章获得者张文军教授。“九五”期间成功申请“轻合金精密成型国家工程研究中心”并任主任，1999年全国五一劳动奖章获得者、2000年全国先进工作者丁文江教授。中国首次被美国精神分裂症与抑郁症研究协会授予2001年度杰出研究者奖贺林教授，从事高速微电子系统互连与封装电特性研究的国家杰出青年科学基金获得，“长江学者奖励计划”特聘教授毛军发。在燃烧与排放控制、城市大气污染控制和激光流场测试研究获重要成果的国家杰出青年科学基金获得者，长江学者奖励计划特聘教授黄震等。 两院院士 类别院士名单全职科学院院士（9人）杨槱（船舶）张煦（通信）徐祖耀（材料）周尧和（材料）雷啸霖（材料）张杰（物理）颜德岳（化学）贺林（生物）邓子新（生物）全职工程院院士（15人）何友声（船舶）林忠钦（船舶）翁史烈（机械）饶芳权（机械）阮雪榆（机械）潘健生（材料）陈亚珠（生医）王振义（医学）张涤生（医学）邱蔚六（医学）陈赛娟（医学）戴尅戎（医学）项坤三（医学）曾溢滔（医学）顾健人（医学）双聘科学院院士（5人）刘永坦（哈工大）陈竺（卫生部）李家明（物理所）徐僖（四川大学）卢柯（金属所）双聘工程院院士（4人）刘永坦（哈工大）杨胜利（上海生物工程中心）葛修润（武汉岩土所）谢友柏（西安交通大学）发展中国家科学院院士（4人）陈竺 邓子新 陈赛娟 张杰贺林已故院士（6人）程孝刚 周志宏张钟俊 江绍基 朱物华 沈天慧***教学团队力学基础课程教学团队（洪嘉振）工业工程主干课程教学团队（江志斌）口腔颌面外科学教学团队（张志愿）大学体育课程教学团队（孙麒麟）国家工科基础课程物理教学基地教学团队（胡其图）工科数学基地教学团队（乐经良）生命科学导论教学团队（林志新）大学英语教学团队（刘龙根） 截至2014年，上海交大拥有***教学及人才培养基地11个，***校外实践教育基地7个，***实验教学示范中心6个，国家工程实践教育中心5个；有***精品课程46门，包含***视频公开课13门、***精品资源共享课程18门，上海市精品课程134门，其中包含***双语示范课程7门。 教学成果***精品课程儿科学 口腔解剖学现代机械工程图学生命科学导论大学体育政治学原理现代遗传学金融工程学制冷与低温原理妇产科学医学影像学战略管理计算机组成与系统结构金融学导论数据结构基本电路理论检测技术基础大学物理实验船舶原理食品工程原理理论力学口腔颌面外科学高等数学数学实验交响音乐鉴赏组织胚胎学行政法与行政诉讼法电路实验医学微生物学工程热力学流体力学数据结构生产计划与控制运营管理临床血液学振动力学外科学大学物理自动控制原理口腔黏膜病学大学英语大学化学市场营销学生物医学影像处理细胞工程材料科学基础***实验教学示范中心工程力学实验教学中心 物理实验教学中心生命科学实验教学中心临床技能实验教学中心电工电子实验教学中心工程训练中心***大学生校外实践基地上海交通大学－上海电气集团股份有限公司工程实践教育中心上海交通大学－上海通用汽车有限公司工程实践教育中心上海交通大学－中航商用飞机发动机有限责任公司工程实践教育中心上海交通大学－新奥集团股份有限公司工程实践教育中心上海交通大学农科教合作人才培养基地上海交通大学法学教育实践基地上海交通大学临床技能综合培训中心学生成绩2001年7月，在荷兰举行的“第14届世界管乐大赛”上，交大学生管乐团获得一等奖。2002年3月，在美国夏威夷举行的“第26届ACM”总决赛，交大学生一举夺得全球总冠军。2002年4月，在美国西雅图举行的“第四届全球商务挑战赛”上，交大管理学院学生夺得亚军。2002年9月，在波兰举办的14届“世界大学生乒乓球锦标赛”上，交大学生获得男子单打冠军、男子双打冠军、男子团体冠军和男女混合冠军。2002年11月，在美国新奥尔良举行的“国际大学生机械设计竞赛”，交大学生获得第二名。2003年7月，交大管乐团又在首届瑞士“少女峰”音乐节管乐团竞赛演出中夺得金奖第一名。2003年8月，在“马斯特杯2003年中国机器人大赛”中，交大学生获得两个项目的冠军和亚军。2005年4月，交大代表队夺得第29届ACM/ICPC全球总决赛冠军。上海交大在建校之初就秉承国际化办学宗旨，早在二十世纪三四十年代，学校就有许多从海外留学归来的教师任教，课程体系与麻省理工学院等名校接轨，本科教学达到世界先进水平。早在1994年就与欧洲管理发展基金共同创建中欧国际工商学院，开辟中外合作办学的先河。2002年，交大在新加坡成立我国在海外设立的第一个研究生院。2006年，建成交大-密西根大学联合学院 ，成为中国高校国际化办学的标志性成果；2009年，以该项目为核心的教学改革荣获教育部颁发的***教学成果一等奖。2012年交大-密西根联合学院和中欧国际工商学院被上海市评为示范性中外合作办学机构。 截至2013年，学校先后与美国MIT、加州大学、密西根大学、杜克大学，与德国海德堡大学、慕尼黑工业大学，英国的牛津、剑桥、帝国理工学院、诺丁汉大学，北欧的瑞典皇家理工学院（KTH）、挪威科技大学（NTNU），比利时的鲁汶大学，澳大利亚的新南威尔士大学、悉尼大学，新加坡国立大学；与GE、GM、Intel、Honeywell、Microsoft、西门子等跨国企业建立了战略合作关系。2012年，本科生海外游学比例已达30.8%，每三个交大本科生中就有一个由学校公派到国外交流深造；超过五千名来自世界各地的留学生在这里学习，在校学位留学生规模已达1674名。国家留学基金委公派研究生项目，每年资助150名研究生到哈佛、耶鲁、牛津、剑桥等一流大学攻读博士学位；博士生海外访学计划，每年资助100名博士生到海外进行联合培养。