工业工程系每年招收约60名本科学生，这些学生的综合成绩位于清华大学录取学生生源的前三分之一左右。

目前共有在校学生438人，其中，本科生275名，包括加拿大、韩国、印度尼西亚、马来西亚和香港等境外留学生17名；硕士研究生123名，其中包括德国和法国的国际留学生30名；博士生40名。工业工程系的学生是一个有思想、有活力、有开拓精神、有追求、勤奋斗的专业群体。从2001年建系以来，已经涌现出多个富有特色、在学校有很好声誉与影响力的集体和个人。在校重大文体赛事中，我系学生获得了非常可喜的成绩，还有多名学生在国际、国内的专业大赛中获得大奖，为清华大学和工业工程系争得荣誉。遵循我系“追求卓越人生，塑造卓越事业”的培养目标，工业工程系的每一位学生都在为自己的理想时刻不懈地拼搏奋斗。学生的毕业前景方面，以2006年全体毕业生为例进行统计，在当年毕业的全体62名本科毕业生中，继续在清华或者国内其他大学和中国科学院攻读硕士研究生或者直接攻读博士研究生的人数为33人，占毕业生人数的53.2%；出国继续攻读硕士研究生或者博士研究生的人数为16人，占毕业生人数的25.8%；灵活就业或者自主创业3人，占4.8%；就业10人，占毕业生人数的16.1%。工业工程系围绕现代工业工程基础、物流工程、制造系统工程、人因工程等领域开展了系列科学研究，承担多项国家自然科学基金、863项目、地方政府项目和国内外企业合作项目，多项科研成果获得国家及省部级科研奖励，每年在美、欧等重要国际杂志发表高水平的学术论文数十篇。