南京工业大学的前身，一个是原化工部直属的南京化工大学，一个是原建设部直属的南京建筑工程学院，化工和建筑两类专业历史积淀最深。

该校的化学工程与技术是国家重点学科，材料科学与工程是国家培育的重点学科，计算机科学与技术、土木工程等是省级重点学科和***。此外，上一轮国内学科评估，该校的轻工技术位居国内前三，安全科学与工程位特色专业居国内前10。上述，都是该校相对优势的专业。