霍普金斯大学的创始人希望抛弃美式学院的陈规旧制，打造一所专注于扩展知识、研究生教育和鼓励研究风气的新式研究型大学。

其目标为：“鼓励研究以及独立学者的进步，使得他们可以通过自己精湛的学识推动他们所追求的科学以及所生活的社会前进。” 仿照威廉·洪堡等人所倡导的以柏林洪堡大学为代表的德国大学模式，霍普金斯大学是美国第一所以讨论班方式授课、第一所分专业录取本科生的大学，其理念和模式都对后来的美国大学产生了巨大的影响并为之纷纷效仿，其中的典型例子就是芝加哥大学。