金融数学与控制科学系成立于2004年，前身是数学系控制科学教研室。

现有教师10人，其中教授4人，副教授2人，讲师4人。已有2名被聘为教育部“长江学者奖励计划”特聘教授, 已获国家杰出青年科学基金2项。本系与信息与计算科学系共同招收信息与计算科学专业本科生，培养学生具有良好的数学素养,掌握信息科学和计算科学的基本理论和方法，使学生受到科学研究的初步训练，能运用所学知识解决实际问题，可成为在科技、教育和经济部门从事研究、教学、应用开发和管理工作的高级专门人才。复旦大学数学研究所于1956年开始筹建，成立时批准部门是中国科学院。其经过如下：1956年，苏步青教授和陈建功教授受中国科学院委托，开始筹建上海数学研究室。1957年6月在复旦大学正式成立了中国科学院上海数学研究室。1958年12月，经中国科学院批准，正式成立中国科学院上海数学研究所，下设几何与函数论两个研究室。中国科学院学部委员苏步青教授任所长。1960年，中国科学院上海数学研究所划归复旦大学，更名为复旦大学数学研究所，设有微分几何、函数论与泛函分析、微分方程、概率论与数理统计等四个研究室，曾经与复旦大学数学系一起在各种杂志上发表论文四百多篇。