两者的区别主要是在于级别上，省人民政府和教育部共建的大学包括了211、985等项目在内，实质上没有什么区别。

省部共建大学是：指国务院相关部委（教育部及其他国家部委）与相关省、直辖市、自治区共建高校。主要为四类：一是教育部与地方政府对985工程大学进行共建，以建设国内一流、国际知名的高水平大学，中央部委拉动地方政府配套支持相关高校发展的规划。二是各行业领域具有高水平的部分行业特色型国家211工程大学，得到教育部、各行业部门对这些重点行业特色型大学进行共建。共建工作旨在指导这些特色高校扩大社会合作、强化社会服务，构建共建各方更稳固、持久的合作关系，发挥共建工作在高水平大学建设中的重要作用。三是部分实力较强的省属大学，得到地方政府与教育部以及其他部委共建，拓展发展经费和资源，建设在全国范围内综合实力强、办学水平高，在全国有一定影响力的高水平大学。教育部为此设立教育部省部共建工作研究中心由教育部直属高校工作办公室直接领导，立足于省部共建。此外，教育部还吸纳这部分高校参加教育部直属高校的部分会议。四是地方政府与教育部之外的其他国家部委重点共建的省属重点大学。这些高校在某一或多个行业领域有较强的师资和科研基础，各部委加强对这些高校的支持力度，由各部委与地方省市签署省部共建协议，积极发展强势学科，提高综合实力，建设一批行业内具有巨大影响力的高水平大学。211工程（Project 211）大学：是为了面向21世纪，迎接世界新技术革命的挑战，中国政府集中中央、地方各方面的力量，重点建设100所左右的高等学校和一批重点学科、专业使其达到世界一流大学的水平的建设工程。“211工程”是中华人民共和国建国以来国家正式立项在高等教育领域进行的规模最大的重点建设工程，是国家“九五”期间提出的高等教育发展工程，也是高等教育事业的系统改革工程。