很难说哪个更好，要看你以后的就业方向，每个人有每个人的想法。

个人认为金融工程不错，进华尔街的金钥匙，对数学要求极高。至于硕士和博士，即使你申请博士，前两年的课程也是硕士课程，所以建议你还是直接申请MS。更多美国留学的信息，请百度“91留学”。