哈尔滨医科大学在全国医学类专业的院校中大体排名十二三名上下；在独立设置的医科院校中，排名三四名左右，实力还是非常强的。在临床医学，哈医大排名全国11名（与中国医科大学、南京医科大学、山东大学、四军大、二军大、重庆医科大学等其所医科大学并列）。