麦吉尔大学一共有22个院系学院，分为11个Faculties和11个schools ，并有4所附属医院 ，提供超过340个本科学术项目和超过250个博士点和硕士项目。

麦吉尔大学以世界顶尖的医学、文学、法学、工程、自然科学和农学著名 ，并为学生提供了广泛的课程学习 。人文社科学院 Faculty of Arts自然科学学院 Faculty of Science工程院 Faculty of Engineering法学院 Faculty of Law医学院 Faculty of Medicine牙科学院 Faculty of Dentistry管理学院 Desautels Faculty of Management教育学院 Faculty of Education农业与环境科学学院 Faculty of Agricultural and Environmental Sciences宗教研究学院 Faculty of Religious Studies建筑学院 School of Architecture城市设计学院 School of Urban Planning计算机科学学院 School ofComputer Science信息研究院 School of Information Studies营养学院 School of Dietetics and Human Nutrition环境学院 School of Environment护理学院 Ingram School of Nursing理疗学院 School of Physical & Occupational Therapy社会活动学院 School of Social Work音乐学院 Schulich School of Music继续教育学院 School of Continuing Studies此外，麦大还有3个附属学院：蒙特利尔教区神学院、美国加拿大联合神学院和蒙特利尔长老会学院。皇家维多利亚学院Royal Victoria School是一所合并到麦大的非教学性学院，曾经专为女生提供膳宿。而成立于1956年的麦吉尔行政研究中心为公司、政府、非盈利机构等提供相关研讨会和可订制的行政管理教育。麦吉尔大学有超过75个研究中心，在世界范围内从事一系列广泛的研究合作。麦吉尔的医学院在世界首屈一指，是无数顶尖学子梦寐以求的地方，美国著名的约翰霍普金森大学医学院的创立者之一威廉奥斯勒即从麦吉尔大学医学院毕业，中国民众熟悉的白求恩大夫也曾在麦吉尔大学附属医院实习、研究和工作，多名医学家在此研究获得重大成果获诺贝尔医学和生理学奖；其法学院是加拿大为数不多的同时研究、教授西方两大法系普通法和民法的学院，在北美独树一帜。 麦克唐纳校区是麦大的分校，内有麦大农业与环境科学学院和营养学院。该学院位于蒙特利尔以西32公里的圣安德贝尔维，有摩根植物园、莱曼昆虫学博物馆、麦吉尔植物标本馆、构架研究所，寄生虫学研究所等以及大片温室和林区。该校每个院系设有各自独立的图书馆，一共有13座图书馆分布校园。