日本设有别科的大学包括但不限于以下几所：

东京大学- 提供涵盖文学、理学、工学等领域的别科课程。

早稻田大学- 别科课程以日语教育为核心，注重培养学生的国际视野和专业技能。

北海道大学- 别科课程覆盖自然科学和人文科学等领域。

筑波大学- 别科课程同样包含广泛的学科领域。

庆应义塾大学- 日本语别科对申请大学院非常重要，竞争激烈。

关西大学- 提供留学生别科，重视别科教育，并设有直升政策。

宝冢医疗大学- 留学生别科特色为学费半年付，提供理疗、柔道整复、针灸等专业。

武藏野大学- 别科旨在培养具有多国语言沟通能力的介护福祉士。

帝京大学、 龙谷大学、 樱美林大学、 城西国际大学等也有别科课程。

别科通常作为大学本科课程的补充，旨在提供更深入的学术研究和专业训练，适合那些希望进一步深化在某个特定领域内的知识或技能的学生。