企业查询员工学历信息可以通过以下几种方法：

员工提供学历证明

要求员工提供学位证书、毕业证书等学历证明文件。

联系学校查询

直接联系员工毕业的学校，核实员工的学历信息。

社会认可的学历认证机构

通过学历认证机构进行认证，提供必要的文件进行核实。

第三方背景调查公司

委托专业的背景调查公司来核实员工的学历及其他背景信息。

学信网查询

登录中国高等教育学生信息网，输入员工姓名和证书编号查询。

学位网查询

登录中国学位与研究生教育信息网，查询学位授予单位、学科专业等详细信息。

国家开放大学官网或人社局网站

对于国家开放大学学历，可在其官网查询，或在当地人社局网站查询。

直接联系毕业院校

人力资源部门直接联系应聘者的毕业院校，通过教务处、学生档案管理部门等核实信息。