美国休斯顿拥有众多高等教育机构，以下是部分知名大学列表：

莱斯大学 （Rice University）

私立研究型大学

被誉为“南方哈佛”

学术和研究领域享有盛誉

休斯顿大学 （University of Houston）

公立研究型大学

德克萨斯州大学系统中最重要的成员之一

学科涵盖自然科学、财经、法律、工程学等领域

德克萨斯大学休斯顿分校 （University of Texas Houston）

公立大学

贝勒医学院 （Baylor College of Medicine）

医学教育机构

西南医学中心 （Southwestern Medical Center）

医学研究机构

休斯顿大学清湖分校 （University of Houston–Clear Lake）

公立大学

圣·托马斯大学 （St. Thomas University）

私立大学

德克萨斯南方大学 （Texas Southern University）

公立大学，主要服务于休斯顿地区的非洲裔和拉丁裔社区