在剑桥大学中，申请难度较高的学院通常是那些录取率较低的学院。根据剑桥大学公布的2019学年级本科入学申请数据，申请人数最多的前三所学院及其录取情况如下：

耶稣学院（Jesus College）：

申请人数最多，达到1235人，但实际录取人数仅有139人，录取率为全剑桥最低。

三一学院（Trinity College）：

申请人数排名第二，实际录取人数排名第一，通常为剑桥大学中规模最大、财力最雄厚、名声最响亮的学院之一。

圣约翰学院（St John's College）：

在学生人数上仅次于三一学院，以宏伟的庭院式建筑而著名，录取难度也相对较高。

因此，根据这些数据，可以认为耶稣学院、三一学院和圣约翰学院的申请难度相对较高。