签订日本留学中介协议时，请遵循以下步骤和注意事项：

合同内容

明确合同期限、服务内容、费用、双方责任和义务。

中介资质

确认中介机构的资质和信誉，可通过官方网站或咨询相关部门了解。

合同条款

仔细阅读合同条款，特别是费用、责任和义务部分。

服务内容与质量

要求中介提供详细的服务内容和质量保证。

合同签订

确认合同签订方式和时间，并妥善保存合同。

专业咨询

如有疑问，可咨询专业律师或相关部门。

选择合法中介

选择在涉外监管网上发布的合法中介名称。

权利义务明确

明确中介服务公司和当事人的权利义务。

退费事宜

确定纠纷或意外情况时的退费条款。

违约责任

明确违约责任，包括违约金和赔偿方式。

费用支付

了解中介的收费方式，如首付款、成功后付款或一次性支付等。

合同样本

参考合同范本，确保合同内容完整且符合双方利益。

在签订合同前，请确保您已充分理解所有条款，并考虑咨询专业法律意见。