日本留学需要办理的手续主要包括以下几个步骤：

申请入学许可

向目标学校提交入学申请，通常需要提供最终毕业证书、成绩单、推荐信、健康诊断书、身元保证书以及日语能力证明（如果报考日语专科则免除）。

申请在留资格认定证明书

通过学校等机构向日本法务省入境管理局申请，获得“在留资格认定证明书”。

申请签证

拿到“在留资格认定证明书”后，向日本驻华大使馆或领事馆申请留学签证。

其他相关手续

办理外国人登记，获得外国人登记证。

如需要打工，事先向入国管理局申请打工许可。

如有需要，办理延长居留期限或更改居留资格的手续。

请注意，以上步骤和所需材料可能会根据具体情况有所变化，建议直接咨询相关日本学校或官方机构获取最新信息