日本留学生在参加日本留学考试（EJU）时，最少需要选择3门科目。具体来说：

文科生需要选择日语、数学1类和文科综合科目。

理科生需要选择日语、数学2类和理科综合科目（物理、化学、生物中选择两门）。

以上信息基于您提供的参考信息，具体科目和分数要求可能会根据您申请的学校和专业有所不同。建议您查看目标大学的具体要求或咨询留学服务机构以获得最准确的信息