选择留学考研的日本学校时，可以考虑以下因素：

专业排名

东京大学：在工程、生命科学和人文学科专业方面表现出色。

京都大学：在工程、医学、计算机科学和物理等领域领先。

大阪大学：在综合科学、人文科学、医学、法律及经济学等领域排名很高。

北海道大学：在自然科学领域表现优异。

学校声誉

东京工业大学、一桥大学、早稻田大学、庆应义塾大学等都是日本顶尖的私立大学。

国际化程度

东京工业大学、大阪大学等国际学生比例较高，国际化程度高。

研究方向

根据你的研究方向选择相应的专业和学校，例如东京大学的理科和工科在世界上处于领先地位。

个人条件

考虑你的专业资质、成绩以及语言能力（如日语或英语），选择适合的学校。

费用与学制

了解不同学校的学费、学制以及是否有奖学金或助学金等经济援助。

毕业前景

考虑学校在国内外的就业前景以及校友网络。

个人兴趣与职业规划

选择与你的兴趣和未来职业规划相符的学校和专业。

请根据以上因素，结合自己的实际情况，进行综合评估后做出选择。