在杭州，选择日本留学的中介机构时，可以考虑以下几个比较知名和口碑良好的机构：

西诺留学

优势：本土化的资源优势和丰富的留学办理经验，提供一站式服务，包括日语培训、留学签证等。

中青留学

优势：拥有政府背景，提供全面的自费出国留学服务，包括签证服务、入学前培训等。

新通留学

优势：与全球众多教育机构建立了紧密合作关系，提供一对一服务，帮助学生制定个性化的留学方案。

樱花国际日语

优势：专业主打日本留学，提供日语培训、办理留学签证等服务，顾问老师具有日本留学背景。

新东方前途出国

优势：提供全面的留学服务，包括考试指导、学校申请、奖学金申请等，并与多个国家的教育机构有合作。

启德教育

优势：提供从语言培训到签证服务的全方位支持，团队了解不同国家和院校的录取特点。

乐申日本

优势：团队成员由日本留学回国人组成，专注于日本读研申请服务，申请成功率高。

选择留学中介时，建议实地考察、比较服务内容和质量、顾问的专业度以及过往的成功案例。同时，也可以参考网上的用户评价和排名信息，但最重要的是找到符合自己需求和预算的机构。