日本留学需要准备以下主要证件：

护照：

有效期至少还有六个月，作为重要的身份证明。

签证：

根据学习层次，可能需要4-1-16签证或4-1-16-3签证。

在留卡：

证明合法居留的证件，需到居住地的区市役所办理。

再入国许可：

留学生回国后，若需返回日本继续学业，需办理此许可。

资格外活动许可：

若需要进行在留资格以外的活动，必须事先申请许可。

国民健康保险证：

在日本居留期间必须加入的医疗保险。

学校申请表格：

申请学校时填写的表格。

身份证及户口本复印件：

用于证明身份和户籍信息。

最高学历毕业证书及成绩单：

证明教育背景和学习成绩。

日语学习证明：

证明日语学习进度和水平。

经费担保人的相关证明：

包括身份证复印件、在职证明、收入与纳税证明等。

亲属关系公证：

证明申请人与经费担保人之间的亲属关系。

印章：

日本常用印章，办理一些手续时需要使用。

请确保所有文件都是最新的，并且符合日本入国管理局的要求。在准备这些文件时，建议详细查阅最新的日本留学政策和要求，以确保顺利入境和居留