日本医学最知名的学校当然是东京大学、京都大学，以及其余几所旧帝大。除了这7所旧帝国大学，旧制六医科大学也毫不逊色，这6所学校影响力丝毫不输旧帝大。

千葉大学

千葉大学，本部设置在日本千叶县千叶市稲毛区的著名研究型国立综合大学。学校的前身是千叶医科大学（旧制），成立于1923年。千叶大学是日本国立大学里唯一单独设置看护学部的大学，医学药学府开设的専攻方向有：医科学、総合药品科学、先端医学药学、先進予防医学共同、先端创药科学。

岡山大学

岡山大学医学部的前身是岡山医科大学，成立于1922年，曾被提议作为帝国大学之一，所以也被称为“准帝大”。在日本文部科学省研究大学强化促进事业和日本后厚生劳动省临床研究核心医院整备事业两个项目同时选中的除了七所旧帝大，只有岡山大学入选。临床医学和物理学的研究领域，属于世界顶尖。医齿药学综合研究科开设的専攻方向有：医齿科学、药科学、生体制御科学、病態制御科学、机能再生・再建科学、社会環境生命科学。

新潟大学

新潟大学，位于日本新潟県新潟市，是明治维新后日本政府创立最早的国立大学之一，被日本国内多家专业教育机构列入“大学入学难关校”的名单。学校的医学科和齿学科是六年制，除此之外还有保健学科。医齿学综合研究科开设的専攻方向有：医科学、口腔生命福祉学、分子細胞医学、生体机能调节医学、地域疾病制御医学、口腔生命科学。

金沢大学

金沢大学位于日本石川县金沢市，是一所著名研究型综合国立大学，也是日本北陆地区的最强学府。其医药学域独树一帜，在日本医疗界享有很高的地位，有“名门”之称，金大医学部及其癌症研究所在世界抗癌研究领域首屈一指。医药保健学综合研究科开设的専攻方向有：医科学、创药科学、保健学、医学、药学。

長崎大学

长崎大学于1857年创立，1949年开设大学教育，作为国立综合大学，在日本国内知名度很高，也是旧六所医科官立大学之一。长崎大学开设有多文化社会学、教育学、经济学、医学、齿学、药学、工学、环境科学、水产学等9个学部。其中医学部的实力非常强，在市实力排名上可与东大媲美。医齿药学综合研究科开设的専攻方向有：保健学、災害・被ばく医療科学共同、医疗科学、新興感染症病態制御学系、放射線医療科学、先進予防医学共同、生命薬科学。

熊本大学

熊本大学是位于日本九州熊本市的一所研究型国立大学，日本超级国际化大学计划成员之一。熊本大学向来以其出色的教学和科研质量闻名国际，而集高学术水平与优美环境为一体正是其独特魅力之所在。熊本大学有名的专业主要有医学、药学和教育学。医学、药学保健学开设的専攻方向有：医科学、医学、保健学、医疗药学、创药·生命药科学。