与其他国家不同，日本国内并没有严格意义上官方发布的本国大学排名。这主要是因为日本大学只按地区排位，以地区上各大学的偏差值高低来决定，并没有统一排位。日本大学分为国立大学和私立大学两类，日本国立大学偏重学术研究，日本私立大学偏重社会实践，两类学校有风格差异，各有优势。

据日本文部科学省发布，日本目前拥有国立大学 86 所，公立大学 86 所，私立大学 603 所，计 775 所大学。学生数量方面，国公立大学由于学校数量较少，加上招生严格和学费低廉，所以学生数仅占全体的百分之五。

由于世界大学排名主要依据学术研究，所以担负着研究机构的国立大学有较好的世界排名和知名度，交大日本大学学术排名前十均为国公立大学。而私立大学由于已毕业学生规模在社会较多，因此在日本就职时略占优势。

日本官方没有私立大学排名，依据国立大学排名及日本民间对大学的一个印象大致分级，结合学术排名和就业水平，反应日本人眼中大学档次。另外各院校拥有不同的优势学科，诸如东京大学法学部、一桥大学经济学部、东北大学文学部、大阪大学外国语学部。

民间排名把日本的大学共分为了 S 级到 F 级。其中，S 级大学最好，是国际超一流大学 ;A 级其次，是国际一流大学 ; 再往下是 B 类国内一流大学、 C 类国内准一流大学、 D 类国内二流大学，以此类推超过 600 所大学被归为 E 、 F 级别大学。

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